На дворе две тысячи тридцать пятый год. Ближайшее будущее в мрачных серых тонах. Япония проводит широкомасштабные исследования живых организмов, что приводит к глобальной катастрофе. Из-за утечки так называемой Материи в крупнейший наукоград страны был закрыт въезд. Проходит порядка двух лет, прежде чем Айко Тачибана узнает тайну гибели близких в этом злополучном городе. К тому же девушка узнает и тайну собственного тела, которое, как оказалось, является ключом к разгадке секрета многих исследований. Главная героиня отправляется в большое путешествие по миру с целью отыскать Материю, вступить с ней в синергию и раскрыть тайну катастрофы.